L'ASD Nuoto 2000 Napoli nasce nel 2000 come Associazione Sportiva Dilettantistica per offrire sul territorio di Napoli e provincia corsi per principianti ed esperti relativi alle discipline acquatiche di Nuoto, Pallanuoto, Salvamento e Acquagym, coordinati da tecnici e istruttori FIN. I settori Nuoto e Pallanuoto rappresentano le attività di punta della società, con quest'ultimo che riesce costantemente ad affermarsi a livello regionale grazie ai risultati derivanti dalla partecipazione ai campionati federali di pallanuoto, nei concentramenti regionali previsti dalle normative federali. La storia dell'ASD Nuoto 2000 trova gloria ed affermazione con i risultati derivanti dalla pallanuoto. La società si afferma nei primi anni grazie ai risultati della squadra femminile. Dopo aver vinto il campionato di Serie C riesce a conseguire risultati importanti anche nel campionato di Serie B nel quale si contende uno dei posti per l'accesso ai play-off per la promozione in A2. Nel 2008 la guida tecnica della squadra femminile viene affidata a Bianca Pirone, storico capitano del primo Setterosa, fino al suo scioglimento nel 2011. Risultati altrettanto importanti sono arrivati poi anche dal settore maschile grazie alla promozione dalla Serie D alla Serie C del 2011 con la formazione guidata da Carlo Varriale. Nel 2013 la guida tecnica del settore maschile viene assunta da Luca Gagliotta che nel 2014 riesce a vincere il campionato di Serie C e a condurre la formazione Under20 fino ai quarti di finale, nel concentramento di Bogliasco. All'esordio in B l'allenatore è Andrea Scotti Galletta che raggiunge il miglior risultato di sempre della società, classificandosi al 4 posto nel girone 4 del campionato di Serie B. Nel corso degli anni il lavoro con i giovani è stato il fulcro delle attività della società. Sono numerosi gli atleti che hanno militato con l'ASD Nuoto 2000 che sono riusciti ad affermarsi brillantemente nelle categorie superiori, sia in campo nazionale che internazionale.